Lipidomics studies on macrophages - RAW 264.7 cells treated with Kdo2-Lipid A and compactin

Introduction | Browse | Search | Download
Mouse-over the above links for more information
Legend:graph_icon: View data/graphs for replicates    graph icon: View graphs of average of replicates
Details/Graph
LM_ID NameMass
(neutral)		 Kdo+Comp
Kdo
Comp
Ctrl
 0 hrs		 Kdo+Comp
Kdo
Comp
Ctrl
 0.5 hrs		 Kdo+Comp
Kdo
Comp
Ctrl
 1 hr		 Kdo+Comp
Kdo
Comp
Ctrl
 2 hrs		 Kdo+Comp
Kdo
Comp
Ctrl
 4 hrs		 Kdo+Comp
Kdo
Comp
Ctrl
 8 hrs		 Kdo+Comp
Kdo
Comp
Ctrl
 12 hrs		 Kdo+Comp
Kdo
Comp
Ctrl
 24 hrs
Units
. . . .
  - TG(40:0)694.6 (ions) -
-
-
0.1		 0.08
0.09
-
-		 0.08
-
0.07
0.09		 -
-
-
-		 0.06
0.06
-
0.06		 0.05
0.03
-
0.06		 0.06
0.065
0.04
0.05		 0.08
0.11
0.055
0.045		 pmol/ug DNA
  - TG(45:4)756.6 (ions) -
-
-
0.16		 0.105
0.12
0.17
0.14		 0.125
0.12
0.185
0.22		 0.13
0.143
0.1
0.13		 0.08
0.12
0.117
0.113		 0.12
0.123
0.077
0.097		 0.117
0.167
0.127
0.077		 0.153
0.143
0.11
0.083		 pmol/ug DNA
  - TG(46:0)778.7 (ions) -
-
-
0.07		 0.06
0.16
0.08
0.08		 0.14
-
0.09
-		 -
-
0.06
-		 0.66
0.35
0.195
-		 0.075
0.39
0.07
-		 0.113
0.095
0.11
-		 0.343
0.17
0.045
-		 pmol/ug DNA
  - TG(46:1)776.7 (ions) -
-
-
0.065		 0.08
0.215
0.085
0.085		 0.21
-
0.09
-		 -
-
0.08
0.06		 0.66
-
0.16
-		 0.075
0.45
0.1
0.04		 0.1
0.15
0.15
-		 0.323
0.123
0.075
0.045		 pmol/ug DNA
  - TG(48:0)806.7 (ions) -
-
-
0.107		 0.097
0.197
0.143
0.107		 0.127
0.085
0.107
0.113		 0.12
0.08
0.107
0.09		 0.415
0.077
0.14
0.087		 0.207
0.24
0.087
0.06		 0.27
0.203
0.127
0.04		 0.673
0.355
0.107
0.03		 pmol/ug DNA
  - TG(48:1)804.7 (ions) -
-
-
0.12		 0.143
0.323
0.203
0.13		 0.227
0.097
0.183
0.157		 0.16
0.133
0.163
0.147		 0.36
0.103
0.193
0.13		 0.233
0.35
0.113
0.063		 0.313
0.243
0.285
0.06		 0.943
0.475
0.22
0.063		 pmol/ug DNA
  - TG(48:2)802.7 (ions) -
-
-
0.073		 0.125
0.24
0.113
0.075		 0.187
0.065
0.11
0.103		 0.155
0.065
0.15
0.097		 0.83
-
0.22
0.105		 0.083
0.61
0.13
-		 0.11
0.1
0.3
-		 0.54
0.233
0.153
0.04		 pmol/ug DNA
  - TG(49:1)818.7 (ions) -
-
-
5.17		 1.88
2.95
0.06
5.03		 2.63
4.05
2.39
5.51		 4.06
3.47
3.03
4.4		 2.34
3.23
2.53
4.04		 0.04
1.34
3.66
2.63		 5.3
4.61
1.56
2.11		 9.66
9.39
4.11
2.13		 pmol/ug DNA
  - TG(49:5)810.7 (ions) -
-
-
0.28		 0.237
0.257
0.327
0.253		 0.27
0.243
0.293
0.263		 0.243
0.257
0.223
0.24		 0.173
0.163
0.197
0.213		 0.245
0.233
0.16
0.147		 0.177
0.193
0.207
0.155		 0.193
0.19
0.163
0.14		 pmol/ug DNA
  - TG(50:0)834.8 (ions) -
-
-
0.183		 0.16
0.237
0.207
0.157		 0.18
0.107
0.16
0.177		 0.2
0.153
0.173
0.177		 0.293
0.137
0.187
0.16		 0.32
0.333
0.16
0.103		 0.42
0.41
0.22
0.08		 0.89
0.397
0.187
0.047		 pmol/ug DNA
  - TG(50:1)832.8 (ions) -
-
-
0.277		 0.283
0.417
0.363
0.267		 0.343
0.227
0.343
0.327		 0.343
0.257
0.307
0.32		 0.463
0.227
0.283
0.26		 0.38
0.467
0.23
0.16		 0.547
0.497
0.32
0.13		 1.39
0.583
0.423
0.13		 pmol/ug DNA
  - TG(50:2)830.7 (ions) -
-
-
0.21		 0.233
0.36
0.29
0.213		 0.297
0.173
0.253
0.233		 0.267
0.197
0.263
0.253		 0.417
0.14
0.237
0.21		 0.275
0.34
0.173
0.107		 0.357
0.267
0.263
0.095		 1.28
0.507
0.46
0.137		 pmol/ug DNA
  - TG(50:3)828.7 (ions) -
-
-
0.06		 0.09
0.36
0.09
0.07		 0.25
0.05
0.073
0.06		 0.083
0.055
0.1
0.08		 0.5
-
0.09
0.07		 0.09
0.36
-
-		 0.12
0.055
0.12
-		 0.527
0.203
0.19
0.055		 pmol/ug DNA
  - TG(51:1)846.8 (ions) -
-
-
-		 0.06
0.29
0.08
-		 0.16
-
-
0.05		 -
-
-
-		 0.48
-
-
0.05		 0.055
0.33
0.08
-		 0.08
0.055
-
-		 0.257
0.625
0.07
-		 pmol/ug DNA
  - TG(51:2)844.8 (ions) -
-
-
0.065		 0.075
0.215
0.1
0.095		 0.09
-
0.073
0.075		 0.08
0.06
0.08
0.08		 0.65
0.08
0.07
0.08		 0.05
0.4
0.075
-		 0.08
0.06
-
0.05		 0.347
0.153
0.103
0.04		 pmol/ug DNA
  - TG(51:3)842.7 (ions) -
-
-
0.075		 0.1
0.25
0.11
0.11		 0.125
0.075
0.09
0.08		 0.09
0.09
0.09
0.085		 0.37
0.07
0.07
0.08		 0.05
0.155
0.055
0.04		 -
0.05
0.13
-		 0.14
0.073
0.07
0.04		 pmol/ug DNA
  - TG(51:4)840.7 (ions) -
-
-
0.583		 0.477
0.593
0.577
0.547		 0.567
0.54
0.667
0.577		 0.5
0.47
0.433
0.527		 0.447
0.483
0.497
0.48		 0.397
0.423
0.38
0.357		 0.307
0.39
0.387
0.317		 0.403
0.413
0.29
0.27		 pmol/ug DNA
  - TG(51:5)838.7 (ions) -
-
-
0.06		 0.07
0.07
0.07
0.07		 0.06
0.06
0.06
0.06		 0.07
0.06
0.06
0.07		 0.09
-
-
0.06		 -
0.06
-
-		 -
-
0.04
-		 0.08
-
-
-		 pmol/ug DNA
  - TG(52:0)862.8 (ions) -
-
-
0.167		 0.143
0.163
0.17
0.157		 0.15
0.107
0.137
0.133		 0.17
0.127
0.137
0.15		 0.3
0.137
0.147
0.147		 0.29
0.27
0.147
0.11		 0.387
0.36
0.19
0.095		 0.92
0.543
0.203
0.06		 pmol/ug DNA
  - TG(52:1)860.8 (ions) -
-
-
0.293		 0.3
0.347
0.353
0.313		 0.343
0.233
0.283
0.307		 0.383
0.277
0.317
0.31		 0.46
0.26
0.323
0.303		 0.373
0.39
0.273
0.2		 0.577
0.523
0.35
0.187		 1.46
0.957
0.577
0.163		 pmol/ug DNA
  - TG(52:2)858.8 (ions) -
-
-
0.317		 0.297
0.437
0.413
0.357		 0.393
0.277
0.32
0.353		 0.43
0.31
0.36
0.347		 0.573
0.277
0.38
0.363		 0.38
0.383
0.313
0.21		 0.537
0.43
0.377
0.223		 1.58
0.943
0.757
0.283		 pmol/ug DNA
  - TG(52:3)856.8 (ions) -
-
-
0.167		 0.193
0.297
0.23
0.203		 0.257
0.163
0.2
0.2		 0.277
0.18
0.233
0.213		 0.503
0.163
0.217
0.197		 0.193
0.223
0.177
0.123		 0.29
0.193
0.213
0.13		 1.25
0.673
0.663
0.207		 pmol/ug DNA
  - TG(52:4)854.7 (ions) -
-
-
0.08		 0.12
0.145
0.115
0.11		 0.13
0.085
0.083
0.09		 0.103
0.085
0.077
0.085		 0.34
0.075
0.08
0.075		 0.077
0.13
0.06
0.045		 0.087
0.06
0.063
0.037		 0.453
0.19
0.21
0.05		 pmol/ug DNA
  - TG(52:5)852.7 (ions) -
-
-
0.327		 0.327
0.29
0.4
0.35		 0.323
0.337
0.363
0.31		 0.33
0.29
0.303
0.307		 0.307
0.257
0.227
0.287		 0.227
0.24
0.2
0.193		 0.19
0.197
0.227
0.157		 0.303
0.223
0.217
0.14		 pmol/ug DNA
  - TG(53:1)874.8 (ions) -
-
-
-		 -
0.16
-
-		 0.1
-
-
-		 -
-
-
-		 0.32
-
0.06
-		 0.045
0.14
0.05
-		 0.07
0.05
0.08
-		 0.22
0.113
0.06
-		 pmol/ug DNA
  - TG(54:0)890.8 (ions) -
-
-
0.07		 0.08
0.135
0.07
0.08		 0.12
0.05
0.06
0.07		 0.067
0.055
0.075
0.065		 0.82
0.06
0.08
0.08		 0.09
0.113
0.067
0.045		 0.147
0.15
0.07
0.04		 0.467
0.27
0.123
0.027		 pmol/ug DNA
  - TG(54:1)888.8 (ions) -
-
-
0.14		 0.173
0.227
0.17
0.143		 0.163
0.133
0.167
0.16		 0.207
0.15
0.183
0.187		 0.28
0.15
0.167
0.163		 0.24
0.243
0.19
0.137		 0.397
0.383
0.213
0.137		 1.34
0.817
0.513
0.123		 pmol/ug DNA
  - TG(54:2)886.8 (ions) -
-
-
0.233		 0.3
0.363
0.297
0.26		 0.283
0.24
0.263
0.313		 0.363
0.26
0.3
0.333		 0.407
0.277
0.303
0.307		 0.33
0.287
0.303
0.23		 0.547
0.44
0.357
0.257		 1.79
1.09
0.907
0.327		 pmol/ug DNA
  - TG(54:3)884.8 (ions) -
-
-
0.207		 0.233
0.287
0.28
0.233		 0.24
0.197
0.25
0.253		 0.32
0.197
0.26
0.253		 0.443
0.203
0.25
0.24		 0.223
0.193
0.24
0.167		 0.377
0.253
0.283
0.207		 1.49
0.923
0.877
0.313		 pmol/ug DNA
  - TG(54:4)882.8 (ions) -
-
-
0.075		 0.1
0.155
0.11
0.18		 0.13
0.075
0.083
0.09		 0.137
0.095
0.097
0.09		 0.437
0.093
0.087
0.077		 0.103
0.09
0.083
0.053		 0.157
0.087
0.087
0.063		 0.8
0.38
0.477
0.13		 pmol/ug DNA
  - TG(54:5)880.8 (ions) -
-
-
0.05		 0.07
0.11
0.08
0.135		 0.09
0.06
0.05
0.05		 0.08
0.06
0.06
0.07		 0.75
0.06
-
0.05		 0.057
0.09
-
-		 0.083
0.055
0.07
-		 0.427
0.2
0.19
0.047		 pmol/ug DNA
  - TG(56:1)916.8 (ions) -
-
-
0.07		 0.06
-
-
0.08		 0.21
-
-
0.07		 0.06
0.05
-
0.07		 0.53
0.045
0.065
0.07		 0.097
0.11
0.095
0.05		 0.12
0.113
0.09
0.06		 0.663
0.29
0.187
0.04		 pmol/ug DNA
  - TG(56:2)914.8 (ions) -
-
-
0.11		 0.12
0.14
0.08
0.13		 0.14
0.1
0.13
0.15		 0.117
0.09
0.09
0.12		 0.17
0.08
0.09
0.085		 0.127
0.097
0.117
0.08		 0.153
0.147
0.13
0.09		 0.913
0.617
0.453
0.127		 pmol/ug DNA
  - TG(56:3)912.8 (ions) -
-
-
0.095		 0.115
0.13
0.105
0.11		 0.11
0.09
0.105
0.11		 0.113
0.1
0.097
0.11		 0.103
0.075
0.093
0.115		 0.113
0.075
0.103
0.08		 0.153
0.12
0.13
0.097		 0.957
0.63
0.62
0.187		 pmol/ug DNA
  - TG(56:4)910.8 (ions) -
-
-
0.075		 0.08
0.1
0.09
0.08		 0.1
0.075
0.07
0.075		 0.107
0.09
0.075
0.085		 0.09
0.06
0.073
0.085		 0.09
0.065
0.073
0.053		 0.167
0.093
0.09
0.073		 0.957
0.54
0.627
0.183		 pmol/ug DNA
  - TG(56:5)908.8 (ions) -
-
-
-		 0.06
0.065
0.07
-		 0.075
0.06
-
0.05		 0.09
0.06
0.07
0.07		 0.065
-
0.05
0.06		 0.057
0.045
0.045
-		 0.117
0.057
0.057
0.05		 0.68
0.367
0.423
0.11		 pmol/ug DNA
  - TG(56:6)906.8 (ions) -
-
-
-		 -
-
-
-		 -
-
-
-		 0.06
0.05
-
-		 -
-
-
-		 0.04
-
-
-		 0.095
0.05
-
-		 0.527
0.227
0.21
0.053		 pmol/ug DNA
  - TG(57:0)932.9 (ions) -
-
-
0.44		 0.38
0.473
0.43
0.423		 0.417
0.39
0.453
0.437		 0.393
0.367
0.347
0.47		 0.407
0.413
0.353
0.377		 0.373
0.4
0.333
0.357		 0.357
0.417
0.347
0.3		 0.84
0.68
0.56
0.313		 pmol/ug DNA
  - TG(57:1)930.9 (ions) -
-
-
0.11		 0.1
0.15
-
0.1		 0.11
0.08
0.11
0.11		 0.08
0.07
0.07
0.08		 0.07
0.065
0.06
0.07		 0.057
0.073
0.073
0.06		 0.09
0.075
0.053
0.053		 0.28
0.177
0.13
0.067		 pmol/ug DNA
  - TG(58:0)946.9 (ions) -
-
-
-		 -
-
-
-		 -
-
-
-		 -
-
-
-		 0.41
-
-
-		 0.05
0.1
0.07
-		 0.065
0.05
0.06
-		 0.24
0.137
0.05
-		 pmol/ug DNA
  - TG(58:1)944.9 (ions) -
-
-
0.06		 0.08
0.36
0.08
0.08		 0.25
-
0.06
0.06		 0.07
0.06
0.07
0.07		 0.68
-
-
0.08		 0.075
0.25
0.08
0.05		 0.107
0.077
0.08
0.045		 0.653
0.313
0.183
0.035		 pmol/ug DNA
  - TG(58:2)942.9 (ions) -
-
-
0.08		 0.08
0.12
-
-		 0.085
0.07
0.08
0.1		 0.07
0.06
0.05
-		 0.16
0.05
0.065
0.08		 0.06
0.085
0.085
0.05		 0.097
0.095
0.07
0.055		 0.527
0.327
0.21
0.05		 pmol/ug DNA
  - TG(58:3)940.8 (ions) -
-
-
0.14		 0.11
0.12
0.02
0.12		 0.13
0.14
0.13
0.14		 0.1
0.09
0.08
0.08		 0.09
0.09
0.095
0.1		 0.1
0.055
0.09
0.07		 0.117
0.12
0.075
0.085		 0.517
0.337
0.31
0.09		 pmol/ug DNA
  - TG(58:4)938.8 (ions) -
-
-
1.07		 1.01
1.11
0.98
1.14		 1.28
1.06
1.4
1.22		 1.02
1.07
0.837
1.01		 1.06
1.27
1.11
1.03		 1.04
0.913
0.983
0.927		 1.15
1.13
0.99
0.96		 1.91
1.73
1.42
0.847		 pmol/ug DNA
  - TG(58:5)936.8 (ions) -
-
-
0.135		 0.14
0.15
0.135
0.135		 0.155
0.12
0.135
0.15		 0.127
0.115
0.103
0.113		 0.095
0.117
0.087
0.107		 0.123
0.097
0.097
0.087		 0.14
0.103
0.103
0.09		 0.505
0.353
0.305
0.14		 pmol/ug DNA
  - TG(58:6)934.8 (ions) -
-
-
0.12		 0.115
0.14
0.1
0.105		 0.13
0.095
0.11
0.13		 0.115
0.095
0.09
0.12		 0.095
0.083
0.075
0.1		 0.087
0.08
0.073
0.07		 0.107
0.097
0.085
0.067		 0.505
0.33
0.255
0.1		 pmol/ug DNA
  - TG(60:0)974.9 (ions) -
-
-
0.18		 0.13
0.17
-
0.15		 0.13
0.17
0.16
0.15		 0.1
0.08
0.06
0.09		 0.093
0.09
0.075
0.1		 0.053
0.06
0.073
0.077		 0.09
0.095
0.065
0.067		 0.147
0.123
0.1
0.07		 pmol/ug DNA
  - DNA0.0 (ions) -
-
-
16		 16.8
16.1
16.5
15.4		 17.1
16.5
16.6
16.3		 17.1
19.4
18.8
17.4		 19.8
19.9
20.1
19		 25.7
24.4
23.8
25.1		 25.4
23.4
26.5
29.4		 22.6
23.1
27.1
34.6		 ug/sample
  - TNF0.0 (ions) -
-
-
340		 562
484
369
358		 1582
3852
374
409		 10825
22480
411
429		 72330
77672
406
537		 110126
108866
481
599		 106528
103277
535
617		 105154
103802
1430
638		 pg/ml

 

*:A total of 122 triacylglycerol ions were interrogated by MS in these experiments, but many species yielded signals close to or below the limits of detection.
View the complete dataset of interrogated ions.