Subcellular Fractionation Studies on Macrophages
Kdo2-Lipid A Experiments
Sphingolipids (SP)
|
| Details/Graph |
Name | Kdo Ctl Cyto |
Kdo Ctl ER |
Kdo Ctl Mito |
Kdo Ctl Nuc |
Kdo Ctl PM |
Kdo Ctl Total |
Units . . . . |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
   | C16 Cer | 18.3( 4.62) 9.73( 1.16) |
292( 20.01) 198( 18.65) |
209( 13.93) 74.3( 4.44) |
176( 29.46) 99.3( 7.47) |
427( 132.42) 275( 19.17) |
172( 2.80) 85.3( 1.09) |
pmol/mg protein |
| | C18 Cer | 5.24( 1.34) 2.87( 0.53) |
29.2( 4.97) 14.5( 4.14) |
18.8( 4.44) 8.69( 1.04) |
18.8( 5.14) 9.61( 1.99) |
28.9( 11.20) 23.7( 0.95) |
14.2( 4.07) 7.27( 1.20) |
pmol/mg protein |
| | C20 Cer | 2.98( 0.93) 2( 0.30) |
8( 0.54) 7.82( 0.66) |
7.26( 1.19) 3.92( 0.31) |
5.58( 2.42) 2.45( 0.34) |
10.8( 2.69) 9.99( 1.11) |
5.65( 2.01) 2.05( 0.29) |
pmol/mg protein |
| | C22 Cer | 2.78( 0.81) 1.21( 0.80) |
28.6( 4.65) 16.2( 2.55) |
19( 4.69) 7.36( 1.59) |
22.4( 5.25) 9.63( 1.46) |
38.5( 3.02) 30.5( 3.82) |
21.7( 1.31) 8.4( 1.05) |
pmol/mg protein |
| | C24 Cer | 5.74( 1.43) 3.03( 0.77) |
51.3( 4.80) 29.6( 4.91) |
39.4( 2.96) 16( 1.74) |
43.9( 6.74) 16.7( 3.82) |
110( 9.22) 56.9( 7.98) |
50( 2.49) 21( 3.95) |
pmol/mg protein |
| | C24:1 Cer | 4.03( 0.75) 5.49( 1.23) |
62.7( 0.63) 47.5( 6.05) |
45.4( 4.40) 21.3( 3.55) |
37.5( 4.65) 26( 3.82) |
84( 13.01) 63.8( 4.43) |
42.6( 2.97) 23( 3.85) |
pmol/mg protein |
| | C26 Cer | 1.77( 0.65) 1.53( 0.22) |
5.73( 0.57) 4.86( 0.91) |
4.74( 0.18) 4.02( 1.34) |
4.96( 2.26) 2.46( 0.67) |
11.6( 0.37) 7.93( 0.78) |
2.22( 1.05) 2.05( 0.61) |
pmol/mg protein |
| | C26:1 Cer | 0.953( 0.32) 0.815( 0.15) |
1.03( 0.41) 2.77( 0.90) |
1.49( 0.28) 1.72( 0.71) |
2.94( 0.74) 1.06( 0.20) |
1.9( 0.91) 2.51( 1.31) |
0.78( 0.18) 0.977( 0.27) |
pmol/mg protein |
| | C16 Sphingomyelin | 267( 17.57) 279( 112.14) |
8056( 2432.14) 10799( 2371.11) |
2283( 387.91) 1804( 250.25) |
1033( 41.25) 1222( 562.01) |
18378( 1297.38) 18076( 2660.67) |
3748( 874.81) 3794( 1008.43) |
pmol/mg protein |
| | C18 Sphingomyelin | 11.7( 2.34) 14.1( 5.14) |
251( 102.94) 399( 125.21) |
75( 23.84) 70.8( 13.88) |
34.8( 11.66) 54.8( 22.51) |
549( 151.23) 702( 120.85) |
125( 31.39) 140( 55.04) |
pmol/mg protein |
| | C20 Sphingomyelin | 13.6( 9.91) 4.57( 1.71) |
78.5( 38.63) 141( 51.39) |
21.2( 8.50) 21.7( 8.69) |
12.7( 4.27) 20.5( 7.93) |
171( 76.08) 196( 73.00) |
35( 14.97) 47.4( 23.72) |
pmol/mg protein |
| | C22 Sphingomyelin | 24.5( 8.33) 31.7( 19.37) |
591( 349.63) 985( 507.61) |
172( 95.83) 147( 84.09) |
74.3( 27.87) 127( 91.98) |
1385( 675.26) 1463( 737.08) |
281( 128.25) 368( 229.55) |
pmol/mg protein |
| | C24 Sphingomyelin | 63.6( 30.06) 84.6( 56.96) |
1638( 1109.32) 2607( 1562.43) |
495( 286.34) 390( 246.91) |
191( 105.87) 339( 271.89) |
4014( 2257.08) 4025( 2290.63) |
782( 407.84) 975( 715.68) |
pmol/mg protein |
| | C24:1 Sphingomyelin | 84.5( 29.40) 124( 81.88) |
2064( 1301.48) 4048( 2062.48) |
583( 314.83) 597( 305.85) |
215( 98.59) 477( 374.38) |
5114( 2467.09) 6284( 3224.89) |
957( 450.83) 1402( 896.24) |
pmol/mg protein |
| | C26 Sphingomyelin | 0.57( 0.28) 1.68( 0.32) |
11.5( 4.62) 19.6( 9.15) |
4.62( 2.02) 6.52( 1.41) |
3.58( 1.09) 3.12( 1.25) |
27( 14.63) 30( 13.70) |
5( 2.05) 8.93( 7.15) |
pmol/mg protein |
| | C26:1 Sphingomyelin | 1.63( 0.36) 1.77( 1.30) |
23.9( 16.47) 42.2( 26.39) |
9.04( 3.73) 8.68( 5.15) |
3.11( 1.07) 5.43( 4.15) |
62( 31.93) 78( 35.75) |
9.81( 5.57) 15.2( 11.54) |
pmol/mg protein |
| | C16 GlcCer | 6.73( 0.29) 6.55( 1.23) |
185( 31.83) 194( 71.87) |
84.5( 12.37) 45.8( 12.15) |
26.7( 3.14) 24( 10.09) |
306( 69.29) 272( 55.99) |
70.3( 15.49) 51( 13.12) |
pmol/mg protein |
| | C18 GlcCer | 0.72( 0.12) 0.4( 0.26) |
11.2( 3.38) 8.99( 3.37) |
5.41( 1.41) 3.08( 1.34) |
1.74( 0.42) 1.47( 0.65) |
14.5( 2.26) 12.1( 2.44) |
3.64( 1.09) 3.05( 0.80) |
pmol/mg protein |
| | C20 GlcCer | 0.46 0.477( 0.12) |
8.03( 2.95) 8.72( 3.45) |
3.89( 0.92) 2.12( 0.88) |
1.21( 0.40) 1.15( 0.44) |
13( 2.92) 11.6( 3.07) |
3.44( 1.34) 2.01( 0.76) |
pmol/mg protein |
| | C22 GlcCer | 1.73( 0.66) 2.15( 1.35) |
84.7( 43.43) 110( 74.98) |
40.9( 18.21) 22.3( 12.66) |
10.2( 4.07) 13.4( 9.64) |
128( 29.87) 121( 46.07) |
34( 15.63) 27.6( 16.43) |
pmol/mg protein |
| | C24 GlcCer | 2.1( 1.37) 3.2( 2.53) |
135( 80.45) 203( 158.38) |
59.7( 35.77) 43.4( 30.64) |
24.1( 12.95) 26.2( 22.55) |
218( 59.21) 191( 108.98) |
55.3( 28.36) 49.6( 37.54) |
pmol/mg protein |
| | C24:1 GlcCer | 1.14( 0.42) 1.63( 1.21) |
56( 32.40) 95.2( 68.70) |
28.1( 14.47) 23.2( 13.60) |
7.78( 3.43) 13( 10.31) |
88( 16.58) 95.2( 43.94) |
21.9( 9.62) 21.6( 14.86) |
pmol/mg protein |
| | C26 GlcCer | 0.125( 0.02) 0.057( 0.02) |
1.14( 0.87) 1.56( 1.05) |
0.8( 0.45) 0.45( 0.32) |
0.427( 0.24) 0.28( 0.16) |
2.37( 1.11) 1.87( 1.78) |
0.537( 0.34) 0.413( 0.28) |
pmol/mg protein |
| | C26:1 GlcCer | 0.14 0.03 |
1.39( 0.82) 2.02( 1.16) |
0.75( 0.43) 0.463( 0.30) |
0.243( 0.09) 0.33( 0.19) |
1.26( 0.36) 1.26( 0.69) |
0.45( 0.33) 0.433( 0.28) |
pmol/mg protein |
| | C16DH Cer | 1.22( 0.14) 0.85( 0.27) |
12.2( 0.26) 5.56( 1.18) |
9.04( 1.52) 2.9( 0.70) |
8.19( 3.36) 2.7( 0.25) |
16.6( 4.56) 12.1( 0.58) |
8( 0.81) 3.31( 0.55) |
pmol/mg protein |
| | C18DH Cer | 0.247( 0.09) 0.37( 0.13) |
2.74( 0.35) 2.04( 0.52) |
2.24( 0.72) 0.793( 0.25) |
2.7( 1.00) 0.667( 0.29) |
2.88( 0.60) 2.72( 0.59) |
1.59( 0.80) 0.977( 0.17) |
pmol/mg protein |
| | C20DH Cer | 0.725( 0.29) 0.67( 0.18) |
1.27( 0.30) 1.1( 0.53) |
0.787( 0.23) 0.55( 0.07) |
0.907( 0.40) 0.78( 0.37) |
1.57( 0.56) 0.767( 0.48) |
0.827( 0.24) 0.45( 0.07) |
pmol/mg protein |
| | C22DH Cer | 0.47 0.32( 0.21) |
2.58( 0.17) 1.54( 0.36) |
1.11( 0.49) 1.05( 0.23) |
1.36( 0.24) 0.537( 0.09) |
5.23( 0.82) 2( 0.73) |
1.14( 0.22) 0.74( 0.25) |
pmol/mg protein |
| | C24:1DH Cer | 0.383( 0.11) 0.453( 0.08) |
2.09( 0.58) 1.23( 0.07) |
2.1( 0.38) 1.58( 0.29) |
1.8( 0.37) 1.31( 0.32) |
2.86( 0.07) 2.28( 0.72) |
1.47( 0.52) 0.823( 0.13) |
pmol/mg protein |
| | C24DH Cer | 0.235( 0.06) 0.48( 0.20) |
2.57( 0.23) 1.72( 0.24) |
2.01( 0.39) 1.12( 0.20) |
1.95( 0.45) 1.07( 0.18) |
3.27( 1.27) 2.34( 0.57) |
2.04( 0.05) 0.947( 0.23) |
pmol/mg protein |
| | C26:1DH Cer | 0.653( 0.33) 0.33( 0.14) |
0.645( 0.03) 1.11( 0.35) |
1.73( 0.56) 0.23( 0.10) |
0.185( 0.01) 0.2( 0.03) |
1.73( 0.43) 1.56( 0.26) |
0.12( 0.02) 0.153( 0.05) |
pmol/mg protein |
| | C26DH Cer | 0.28 0.21( 0.05) |
1.34( 0.23) 2.06( 0.54) |
0.663( 0.10) 1.36( 0.56) |
1.46( 0.20) 0.63( 0.26) |
1.98( 0.86) 1.34( 0.37) |
0.293( 0.12) 0.72( 0.05) |
pmol/mg protein |
| | C16DH Sphingomyelin | 122( 22.56) 105( 6.02) |
843( 89.50) 1335( 245.07) |
344( 40.86) 289( 29.40) |
206( 24.75) 169( 16.55) |
1229( 264.36) 2319( 516.52) |
372( 30.23) 418( 87.49) |
pmol/mg protein |
| | C18DH Sphingomyelin | - 3.98( 0.40) |
39.7( 14.22) 63.6( 18.21) |
15.4( 10.68) 16.7( 5.05) |
12.5( 2.97) 5.33( 0.81) |
44.8( 10.59) 112( 48.85) |
12.9( 1.54) 20.4( 2.40) |
pmol/mg protein |
| | C20DH Sphingomyelin | 4.34( 2.75) 1.02( 0.03) |
30.3( 3.64) 36.5( 2.33) |
13.5( 5.03) 13.3( 0.40) |
6.88( 4.04) 5.1( 3.89) |
36.7( 5.13) 83.6( 10.37) |
11.8( 0.49) 14.5( 3.16) |
pmol/mg protein |
| | C22DH Sphingomyelin | 8.12( 6.05) 2.54( 0.95) |
20.2( 2.24) 57( 13.27) |
17.1( 2.09) 5.59 |
17.1( 8.98) 4.86( 0.70) |
24( 8.40) 108( 33.01) |
12.7( 2.75) 15( 3.76) |
pmol/mg protein |
| | C24:1DH Sphingomyelin | 12.1( 0.61) 14.3( 6.16) |
199( 14.67) 548( 168.23) |
90.1( 15.71) 47.7( 7.31) |
31.8( 5.36) 31( 13.39) |
266( 70.91) 821( 289.26) |
148( 34.41) 113( 36.89) |
pmol/mg protein |
| | C24DH Sphingomyelin | - 4.94( 1.18) |
24( 4.89) 56.2( 19.24) |
4.23( 1.46) 8.36( 1.56) |
5.28 4.48( 2.01) |
38.5( 15.02) 107( 60.42) |
17.7( 6.49) 13.8( 3.39) |
pmol/mg protein |
| | C26:1DH Sphingomyelin | 5.08 2.07( 0.02) |
3.64 2.28( 0.41) |
9.23 2.26( 1.16) |
6.22( 1.97) 1.56( 0.40) |
- 10.6( 2.24) |
1.32( 0.96) 3.81( 1.81) |
pmol/mg protein |
| | C26DH Sphingomyelin | 9.04( 5.81) 2.98 |
2.19 7.03( 1.71) |
6.4 9.83( 7.47) |
2.39( 1.00) 1.22( 0.37) |
7.34( 0.33) 9.49( 4.98) |
1.53( 0.75) 1.77( 1.21) |
pmol/mg protein |
| | C16DH GlcCer | 0.11( 0.05) 0.143( 0.03) |
3.22( 0.27) 3.06( 0.62) |
1.23( 0.06) 1.01( 0.03) |
0.487( 0.10) 0.44( 0.17) |
3.86( 1.37) 4.56( 0.80) |
1.21( 0.23) 1.08( 0.10) |
pmol/mg protein |
| | C18DH GlcCer | 0.04 0.06 |
0.15( 0.10) 0.3( 0.09) |
0.117( 0.06) 0.103( 0.03) |
0.03 0.06( 0.01) |
0.285( 0.04) 0.26( 0.02) |
0.083( 0.01) 0.14( 0.06) |
pmol/mg protein |
| | C20DH GlcCer | 0.04( 0.00) 0.057( 0.02) |
0.11( 0.07) 0.145( 0.09) |
0.083( 0.00) 0.045( 0.01) |
0.11 0.06( 0.02) |
0.175( 0.13) 0.193( 0.03) |
0.063( 0.01) 0.033( 0.01) |
pmol/mg protein |
| | C22DH GlcCer | 0.04 0.08 |
0.51( 0.12) 0.497( 0.18) |
0.167( 0.03) 0.155( 0.06) |
0.133( 0.03) 0.065( 0.03) |
0.605( 0.39) 1.07( 0.17) |
0.22( 0.03) 0.153( 0.06) |
pmol/mg protein |
| | C24:1DH GlcCer | 0.14( 0.10) - |
0.353( 0.14) 0.923( 0.29) |
0.207( 0.04) 0.17( 0.11) |
0.115( 0.01) 0.105( 0.04) |
0.445( 0.08) 0.913( 0.17) |
0.157( 0.04) 0.143( 0.07) |
pmol/mg protein |
| | C24DH GlcCer | 0.02 0.02 |
0.517( 0.07) 0.91( 0.46) |
0.197( 0.03) 0.13( 0.03) |
0.075( 0.02) 0.08( 0.06) |
0.71( 0.12) 0.627( 0.20) |
0.377( 0.03) 0.167( 0.13) |
pmol/mg protein |
| | C26:1DH GlcCer | 0.03 0.02 |
0.11 0.067( 0.01) |
- 0.04 |
0.06 0.02( 0.00) |
- 0.06 |
0.01 0.01( 0.00) |
pmol/mg protein |
| | C26DH GlcCer | 0.103( 0.07) 0.03 |
- 0.09 |
0.08 - |
0.03 0.01 |
- 0.08( 0.02) |
0.03 0.04( 0.03) |
pmol/mg protein |